نظر به اثرگذاری چشمگیر فناوری اطلاعات و ارتباطات در عرصه‌های پژوهشی و آموزشی، توجه جدی به بهره‌برداری بهینه از آن، از بدو تأسیس مؤسسه در دستور کار قرار داشته که به اَشکال مختلف درساختارهای قبلی در نظر گرفته شده است. با توجه به گسترش فعالیت‌ها و نیز سیاست یکپارچه‌سازی مدیریت حوزه‌های مرتبط با فناوری، اداره کل فناوری اطلاعات و ارتباطات با مأموریت تأمین بستر و ابزارهای فناوری اطلاعات و ارتباطات و نگهداری و پشتیبانی از آنها در اوایل سال 1390 در ساختار سازمانی مؤسسه مصوب گردید. مأموریت‌های این اداره کل، ذیل سه مدیریت با عناوین «مدیریت زیرساخت و پشتیبانی کاربران»، «مدیریت امور نرم‌افزاری» و «مدیریت توسعه‌ی فناوری» طراحی و تعریف شده که اهم فعالیت‌های آنها تا کنون به شرح زیر است:

• طراحی و راه‌اندازی پایگاه‌های اطلاع‌رسانی و پژوهشی

♦ پانزده دامنه‌ی اینترنتی نظیر: پایگاه‌های حدیث نت، اطلاع‌رسانی دارالحدیث، اطلاع‌رسانی کتابخانه‌های ایران، همایش های، مجله‌ی علوم حدیث، شهر حدیث، حدیث سافت و ...

• طراحی و تولید نرم‌افزارهای پژوهشی عمومی

♦ نرم‌افزارهای تلفن همراه و رایانه‌ای نظیر: دانشنامه‌ی امام حسین (علیه السلام)، منتخب میزان الحکمه، حج و عمره و ...

• طراحی و تولید نرم‌افزار ساماندهی اطلاعات

♦ شامل 437 جلد کتاب و 1798 مقاله‌ی تخصصی مؤسسه (مشتمل بر 364661 حدیث) تا کنون

• طراحی و تأمین سامانه‌های الکترونیک فرآیندهای کاری

♦ سامانه‌های اداری و مالی، تغذیه، کتابخانه، گردش کاری، ارتباطات بین الملل و ...

• تأمین و مدیریت سرویس‌دهنده‌های پایگاه‌های اینترنتی
• مدیریت و پشتیبانی شبکه‌ی داخلی مؤسسه و توابع آن
• مدیریت و ارائه‌ی بانک اطلاعات نرم‌افزاری علوم اسلامی به پژوهشگران، دانشجویان و کارکنان

♦ بالغ بر 120 عنوان نرم‌افزار

• تأمین و مدیریت دسترسی پژوهشگران، دانشجویان و کارکنان به شبکه‌های اینترنت و اینترانت